প্রোটিন বা আমিষ জাতীয় খাদ্য পরিপাকে পেপসিন, জিলেটিনেজ, ট্রিপসিন, ইলাস্টেজ, কোলাজিনেজ, প্রোলিডেজ, পেপটাইডেজ ইত্যাদি এনজাইম ব্যবহৃত হয়।